生検検体や手術検体から標本を作製し、病理専門医による病理診断を行います。病変が非特異的炎症もしくは特異的感染症であるか、または良性腫瘍もしくは悪性腫瘍であるかなどの最終判定を行います。確定診断には免疫染色や遺伝子診断も追加検討する場合があります。確定診断や治療方針の決定、治療効果判定などの重要な業務を日々担っています。

組織から剝離した細胞や擦過または胸腹水から穿刺吸引等で採取した細胞、あるいはリンパ節等から穿刺吸引で採取した細胞から標本を作成し、顕微鏡で観察します。腫瘍性病変の有無や炎症性変化などを確認します。細胞検査士2名でのダブルチェック後、疑わしい細胞がある場合には細胞診専門医とともに詳細に検討し最終報告します。

組織診断：手術中に病変の切除断端の評価やリンパ節転移の有無を調べます。標本作成から結果報告まで20分程度で行います。病理診断では手術中の患者様の手術状況をモニターしており、術者に対し病理画像を提示して迅速かつ詳細な結果報告に努めています。
細胞診断：手術中に採取された検体（主に胸水や腹水、胸腔・腹腔洗浄液）中の癌細胞の有無を診断します。

現在の高度な診断技術や治療法の進歩にも関わらず、病態解明が困難で、不幸にもお亡くなりになられた患者様の病態解明とより良き医療をさらに進歩させていくために病理解剖による詳細な検討を行います。

病理専門医不在の公的医療機関の術中迅速遠隔病理診断も積極的にサポートしています。

手術症例の患者様の手術標本の詳細な検索や術後療法の検討に関しても外科系・内科系・放射線科医とともに病理専門医が参加してよりよい医療を提供するための術後のカンファレンスを行っています。